Screening variante SARS-CoV-2 prin real-time RT-PCR

Descriere

Informații generale

Modificările continue în structura genomului cu apariția noilor variante virale circulante SARS-CoV-2 implică necesitatea unei strategii de testare rapide și eficiente – screeningul de laborator pentru adoptarea măsurilor de sănătate publică, menite să controleze gradul de răspândire a virusului. Se utilizează tehnici de amplificare a acizilor nucleici (metoda real-time Reverse Transcriptase Polymerase Chain Reaction – real-time RT-PCR) de tip multiplex.

 

Pregătire pacient

Tipul probei este reprezentat de produsele biologice provenite de la pacienți cu/fără simptomatologie de boală compatibilă cu infecția respiratorie virală, recoltate în sistemul sanitar (spitale, ambulatoriu, clinici private sau medici de familie): tampon nazofaringian și faringian, spălătură nazofaringiană și orofaringiană, iar de la pacienții cu afectare respiratorie acută severă – aspirat endotraheal sau lavaj bronhoalvelolar.

Exsudatele nazo-faringiene sau faringiene trebuie prelevate în maxim 3 zile de la debut, dimineaţa, pe nemâncate, sau la cel puţin 3 ore după masă ori după igiena bucală.

Transportul probelor către laborator se face în recipient izoterm cu gheță sau pachete refrigerate, la rece (+2°C pana la +8°C), în maxim 48h de la primire.

 

Semnificație clinică

SARS-CoV-2 evoluează încontinuu prin acumularea de mutații în genomul său. O mutație corespunde unei modificări a secvenței genomului ARN, creând o variantă a virusului. Testul se efectuează pentru detectarea mutațiilor de interes cunoscute.

 

Interval biologic de referință / rezultat

Cele mai multe secvențe ale variantei Omicron includ o deleție la nivelul genei S, care poate duce la lipsa detecției prin RT-PCR, particularitate care este folosită drept marker pentru screening-ul detecției variantei Omicron. Cu toate acestea, confirmarea trebuie obținută prin secvențiere genică.

Severitatea infecției cu varianta Omicron pare mai mică decât cea a infecției cu Delta, însă transmiterea crescută poate pune o presiune suplimentră asupra sistemelor de sănătate și poate duce la o morbiditate crescută, în special în populațiile vulnerabile.

 

Raportarea rezultatului: 1-2 zile lucrătoare

 

Interval de recoltare
Luni-Vineri: 07:30-11:00