Secvențiere genom virus gripal, Nanopore

Descriere

Informații generale

Testul secvențiază întregul genom al virusului gripal (tip A și B) folosind tehnologia Nanopore NGS. Aceasta metodă permite:

• identificarea tulpinilor circulante și a mutațiilor relevante;
• supravegherea epidemiologică a circulației virusului;
• monitorizarea apariției variantelor emergente și a rezistenței la antivirale.

Important: nu este utilizat pentru diagnostic clinic individual sau pentru evaluarea severității bolii la pacient.

Pregătire pacient

• Probe: exsudat nazofaringian sau faringian, recoltate în faza acută a infecției (ideal primele 3–5 zile de la debutul simptomelor).
• Nu necesită pregătire specială a pacientului.
• Probele trebuie recoltate corect, transportate și depozitate conform protocolului laboratorului pentru a evita degradarea virală.

Semnificație clinică

• Secvența completă a genomului permite:
  • identificarea tulpinii circulante;
  • urmărirea mutațiilor care pot influența vaccinarea și tratamentul antiviral;
  • compararea cu secvențele din bazele de date internaționale pentru supraveghere globală.
• Nu oferă informații despre severitatea bolii, starea imunologică sau prognosticul pacientului.

Interval biologic de referință / rezultat

• Calitativ: secvență completă a genomului viral.
• Raportul include caracteristicile tulpinii, mutațiile detectate și relevanța epidemiologică.

Interval de recoltare

• Luni–Vineri: 07:30–11:00;
• Primele zile de la debutul simptomelor respiratorii.

Limitări / precauții

• Sensibilitatea depinde de încărcătura virală și calitatea probei.
• Nu este recomandat pentru diagnostic individual sau evaluarea severității clinice.
• Probe cu încărcătură virală foarte scăzută pot genera secvențe incomplete.

Raportarea rezultatului:

• 1-3 săptămâni