Detectarea genomului virusurilor respiratorii prin real-time RT-PCR multiplex

Descriere

Informații generale

Detectarea (identificarea) unuia sau a mai multor fragmente/gene de interes din structura genomurilor virusurilor respiratorii, într-o singură reacție, poartă numele de metodă de detectare real-time RT-PCR (Reverse Transcriptase Polymerase Chain Reaction) multiplex. Panelurile respiratorii 1, 2 si 3 sunt truse de detectare a mai multor posibile ținte (acizi nucleici).

Panelul respirator 1 detectează gene de interes aparținând virusului gripal A, virusului gripal B, virusului respirator uman sincițial A, virusul respirator uman sincițial B și subtipizarea virusului gripal A (virusul gripal uman A subtip H1, H3 și H1pdm09).

Panelul respirator 2 detectează gene de interes aparținând virusurilor umane: adenovirus, metapneumovirus, enterovirus, virusurile paragripale 1, 2, 3 și 4.

Panelul respirator 3 detectează gene de interes aparținând virusurilor umane: bocavirus 1/2/3/4, rinovirus A/B/C și coronavirusurile 229E, NL63 și OC43.

 

Pregătire pacient

Produse biologice provenite de la pacienți, recoltate în sistemul sanitar (spitale, ambulatoriu, clinici private sau medici de familie): tampon nazofaringian și faringian.

Exsudatele trebuie prelevate în primele 1-5 zile de boală, dimineaţa, pe nemâncate, sau la cel puţin 3 ore după masă / după igiena bucală, în recipient cu mediu de transport viral și cu capac bine închis.

Transportul probelor către laborator se face în recipient izoterm cu gheță sau pachete refrigerate, la rece (+2°C pana la +8°C) în max. 48h de la prelevare.

 

Semnificație clinică

Infecțiile respiratorii virale au ca principali agenți etiologici virusul SARS-CoV-2, virusurile gripale tip A și B, virusul respirator sincițial. Pe langă acestea, în prezent mai sunt recunoscute și alte virusuri respiratorii care duc la infecții ale tractului respirator superior sau inferior cu simptomatologii diverse. Aceste virusuri respiratorii pot fi: adenovirus, metapneumovirus, enterovirus, virusurile paragripale 1, 2, 3 și 4, bocavirus 1/2/3/4, rinovirus A/B/C și coronavirusurile 229E, NL63 și OC43.

Testul se efectuează pentru detectarea/identificarea fragmentelor de acizi nucleici, aparținând genomurilor acestor virusuri în probe biologice provenite de la pacienți cu simptomatologie de infecții ale tractului respirator și cu suspiciune de infecție virală.

 

Interval biologic de referință / rezultat

Detectarea din produse biologice umane a virusului urlian sau EV-D68 prin real-time RT-PCR este o analiză de tip calitativ, rezultatul fiind exprimat ca pozitiv, incert, invalid sau negativ.

Un rezultat incert sau invalid (lipsa controlului intern de reacţie) impune recoltarea unei noi probe biologice.

Rezultatele trebuie interpretate în concordanță cu datele clinice și contextul epidemiologic.

Un rezultat fals negativ se poate produce dacă proba clinică prezintă un număr insuficient de copii genomice virale, rezultat ca urmare a momentului inadecvat de recoltare, transportului sau a manevrării.

 

Raportarea rezultatului: 1-2 zile lucrătoare

 

Interval de recoltare
Luni-Vineri: 07:30-11:00