Detectare ARN viral SARS-CoV-2 prin real-time RT-PCR

Descriere

Informații generale

Diagnosticul de laborator al infecțiilor respiratorii virale se realizează prin detectarea (evidențierea) ARN-ului viral specific virusului SARS-CoV-2 în probe biologice umane, utilizând tehnici de amplificare a acizilor nucleici (metoda real-time Reverse Transcriptase Polymerase Chain Reaction – real-time RT-PCR).

Procesul in-vitro de amplificare genică pornește de la ARN-ul specific virusului extras din probe biologice umane, apoi pentru confirmarea prezenței fragmentelor de acizi nucleici ARN ale genelor de interes, acestea sunt trancrise într-o catenă complementară de tip ADN, catenă ce va fi multiplicată într-un număr semnificativ de copii, care pot fi detectate prin cuantificarea fluorescenței emise în timpul reacției.

 

Pregătire pacient

Produse biologice provenite de la pacienți cu/fără simptomatologie de boală compatibilă cu infecția respiratorie virală cauzată de SARS-CoV-2, recoltate în sistemul sanitar (spitale, ambulatoriu, clinici private sau medici de familie): tampon nazofaringian și faringian, spălătură nazofaringiană și orofaringiană, iar de la pacienții cu afectare respiratorie acută severă aspirat endotraheal sau lavaj bronhoalvelolar.

Exsudatele nazo-faringiene trebuie prelevate în maxim 3 zile de la debut, dimineaţa, pe nemâncate, sau la cel puţin 3 ore după masă ori după igiena bucală, în recipient cu mediu de transport viral și cu capac bine închis.

Transportul probelor către laborator se face în recipient izoterm cu gheță sau pachete refrigerate, la rece (+2°C pana la +8°C), în maxim 48h de la primire.

 

Semnificație clinică

Coronavirusurile (CoV) sunt virusuri de tip ARN care infectează atât omul cât și animale. Aspectul „de coroană” (de unde și denumirea) este dat de existența unor spiculi proeminenți pe suprafața virusului (aspect observat în microscopia electronică). Coronavirusul sindromului respirator acut sever SARS-CoV-2 a cauzat pandemia de pneumonie atipică. Boala dată de SARS-CoV-2 este denumită COVID-19 (Coronavirus Infectious Disease 2019) și este o boală contagioasă caracterizată de simptome predominant respiratorii: febră, tuse seacă, dispnee, pneumonie bilaterală interstițială, insuficiență respiratorie sau detresă respiratorie acută, iar persoanele cu comorbidități prezintă un risc mai mare de boală severă.

Testul se efectuează pentru confirmarea suspiciunii de infecție respiratorie virală, deoarece permite detectarea prezenței genomului specific acestui virus în proba biologică a pacientului, prelevată în primele zile de la debutul simptomelor clinice.

 

Interval biologic de referință / rezultat

Detectarea ARN specific virusului SARS-CoV-2 este o analiză de tip „calitativ”, rezultatul fiind exprimat ca pozitiv/detectat, incert, invalid sau negativ/nedetectat.

Un rezultat incert sau invalid (lipsa controlului intern de reacţie) impune recoltarea unei noi probe biologice.

Rezultatele trebuie interpretate în concordanță cu datele clinice și contextul epidemiologic. Rezultatul „negativ” nu exclude posibilitatea infecției cu SARS-CoV-2. Un rezultat fals negativ poate fi explicat printr-un număr insuficient de copii genomice virale, din cauza prelevării necorespunzătoare, probă recoltată prea devreme sau prea târziu în cursul infecției, manevrare și transport necorespunzător, mutații, inhibitori etc.

 

Raportarea rezultatului: 1-2 zile lucrătoare

 

Interval de recoltare
Luni-Vineri: 07:30-11:00