Analiza filogenetică a norovirusurilor prin PCR și secvențiere Sanger

Descriere

Serviciul include:

– extracție manuală ARN din materii fecale;

– reverstranscriere și PCR două fragmente parțial suprapuse, care conțin joncțiunea ORF1-ORF2;

– secvențiere Sanger (4 reacții per probă), instrument SeqStudio Genetic Analyzer, Applied Biosystems;

– interogare baze de date internaționale pentru  determinare genogrup și genotip;

– analiza filogenetică a secvențelor.

Calitate minimă probe pentru analiză:

– probe de scaun (materii fecale) fără mediu de transport, colectate la maxim 72 ore de la debutul simptomelor;

– probe păstrate 2-3 zile la circa 4°C, refrigerate imediat după momentul colectării;

– probe păstrate 2-3 săptămâni la circa -70°C (sau -20°C, dacă prima variantă nu este disponibilă), refrigerate imediat după momentul colectării;

– transport în recipient izoterm cu elemente de răcire.

Timp de lucru: maxim 10 zile lucrătoare.